Prácticas de investigación científica en el Centro Universitário do Sul de Minas comenzaron en 2002 cuando se creó la Coordinación de Iniciación Científica, implementando políticas destinadas a promover la investigación en la región.
En 2006, la institución firmó un acuerdo con la Fundación para el Apoyo a la Investigación en Minas Gerais – FAPEMIG, que financió 8 becas para la Iniciación Científica a través del Programa de Becas de Iniciación Científica – PIBIC. En 2007, este número aumentó a 17 becas.
En los años siguientes, la investigación continuó avanzando con la participación en el Programa de Becas BIC Junior, que ofrece 10 becas para estudiantes de escuelas públicas de educación secundaria.
Siendo seleccionada como una unidad calificada para la ejecución de actividades de I+D por el Ministerio de Ciencia y Tecnología, la institución desarrolló alianzas con varias empresas privadas de la región.
El alcance de los programas de iniciación científica se expandió, ofreciendo actualmente 25 becas para estudiantes académicos, 20 becas BIC Junior para estudiantes de educación primaria y secundaria, y alrededor de 10 becas de FEPESMIG.
En 2014, se estableció una red de acuerdos de investigación con otras universidades extranjeras, la Red ACINNET. Está compuesta por universidades de 9 países. En 2015, Unis fue sede del I Congreso Internacional, donde se presentaron más de 100 proyectos de investigación científica.
También en 2015, la Revista Interação fue recomendada por la CAPES con una estratificación B5 en 4 áreas del conocimiento. En junio de ese año, se finalizó un acuerdo de investigación con la Universidad de Taubaté (Unitau) y varias empresas del sur de Minas Gerais.
En 2016, se promovió el II Congreso Internacional (www.ci.unis.edu.br), que marcó el primer semestre del año y se convirtió en una tradición institucional en el calendario académico y regional. El departamento ganó 5 premios de innovación entre 2016 y 2019.
Durante los últimos 4 años, el departamento ha alcanzado más de 800 publicaciones por año (incluyendo revistas, eventos, libros y capítulos de libros).
En 2019, con la aprobación y recomendación del primer Máster Académico en Gestión y Desarrollo Regional por parte de la CAPES, el CEPI se reorganizó en la Dirección de Innovación y el Departamento de Investigación. Al mismo tiempo, FAPEMIG aprobó la concesión de dos becas para el programa de maestría a través del PAPG.